El español, de 21 años de edad, superó por 745/1000 al alemán Stefan Bradl (Honda) , segundo en los ensayos, y a su compatriota y compañero de equipo, Dani Pedrosa, que suscribió el tercer mejor crono, a 888/1000 milésimas.
Márquez lidera el campeonato del mundo gracias a su victoria en la primera carrera de la temporada el mes pasado en Qatar.
El español, campeón mundial más joven en la historia de la categoría reina, encabeza la temporada de 2014 luego de recuperarse de una fractura del peroné derecho en febrero.
Las calificaciones para la pole position están programadas este sábado a las 14:10 locales (19:10 GMT) .
En la categoría de Moto2, el suizo Thomas Luthi (Suter) marcó el mejor tiempo de la tercera y última sesión de entrenamientos libres con 2:10.871 minutos, seguido de los españoles Maverick Viñales (Kalex) , a 68 milésimas, y Esteve Rabat a 155/1000 de segundos.
El español Efrén Vázquez (Honda) mantuvo su dominio del viernes y clavó el mejor crono en Moto3 al completar la vuelta más rápida en 2:16.525 minutos.
Vázquez superó a sus compatriotas Alex Márquez (Honda) por 636/1000 y Alex Rins por 765/1000.
El líder del Campeonato del Mundo, el australiano Jack Miller (KTM) , se conformó con el 7º lugar a 1:045/1000 del líder.