Once años después,  junto a    Pérez Molina  fundaron el Partido Patriota (PP), que en 2003 los llevó al Congreso como diputados.

legislativos se caracterizaron por la constante citación a funcionarios de turno para cuestionarlos  por actos de corrupción, hasta que renunció en agosto de 2011 para ser candidata a la vicepresidencia.

El Partido Patriota ganó los comicios y Baldetti se convirtió en la primera mujer vicepresidenta. En su primer discurso afirmó que instalaría una secretaría de transparencia.

El 9 de abril de 2015 el vehículo de la vicepresidenta colisiona en la zona 15; era como una premonición. El 9 de mayo queda arraigada y el 24 de agosto es ligada a proceso por su posible implicación en una estructura dedicada a la defraudación de la SAT.

Baldetti pasó de vivir en colonias populares a ser propietaria de mansiones y casas de descanso en la Costa Sur, pero actualmente está recluida en la cárcel Santa Teresa, zona 18.