Flores es buscado desde finales de enero último por la Policía para que comparezca ante una comisión investigadora del Congreso salvadoreño.
Tras dos comparecencias ante la comisión, el 7 y el 28 de enero, Flores no acudió a una tercera cita, por lo que los diputados pidieron a la Policía ese día obligarlo a ir a declarar, sin que hasta ahora haya sido localizado, según las autoridades.
En su primera declaración ante la comisión de la Asamblea Legislativa, Flores admitió que recibió donativos de Taiwán en cheques a su nombre y al margen de las cuentas públicas por, al menos, entre US$15 millones y US$20 millones, pero insistió en que desconocía específicamente los US$10 millones denunciados por Funes.