Mientras en la primera vuelta de los cinco millones 390 mil 5, el voto nulo alcanzó los 225 mil 026 (4.17 por ciento).
Entre los departamentos con más votos nulos se encuentran Totonicapán con 4.15 por ciento (4 mil 147) de los 99 mil 875 emitidos.
Luego se encuentra San Marcos, pues de los 252 mil 529 (48.92 por ciento) votos emitidos el 3.12 por ciento, es decir 7 mil 890 fueron nulos.
Los votos en blanco también presentaron un baja pues de 270 mil 970 registrados en la primera vuelta pasaron a 70 mil 517, lo que representa 1.66 por ciento de los votos emitidos.
Cuadro de votos nulos por departamento
| Departamento | cifra -voto nulo- | % -voto nulo- |
| Guatemala | 13 mil 251 | 2.07% |
| Chimaltenango | 3 mil 209 | 1.91% |
| El Progreso | 1 mil 177 | 1.98% |
| Escuintla | 5 mil 659 | 2.23% |
| Santa Rosa | 2 mil 794 | 2.37% |
| Sololá | 2 mil 853 | 2.14% |
| Totonicapán | 4 mil 147 | 4.15% |
| Quetzaltenango | 5 mil 276 | 2.39% |
| Suchitepéquez | 3 mil 819 | 2.38% |
| Retalhuleu | 2 mil 505 | 2.69% |
| San Marcos | 7mil 890 | 3.12% |
| Huehuetenango | 6 mil 180 | 2.58% |
| Quiché | 5 mil 834 | 2.38% |
| Baja Verapaz | 2 mil 336 | 3.12% |
| Alta Verapaz | 8 mil 930 | 2.79% |
| Izabal | 2 mil 362 | 2.19% |
| Zacapa | 1 mil 778 | 2.13% |
| Petén | 3 mil 452 | 2.96% |
| Jalapa | 2 mil 205 | 2.42% |
| Jutiapa | 2 mil 856 | 1.95% |
| Chiquimula | mil 150 | 2.72% |
Abstencionismo
El voto ciudadano disminuyó en la segunda vuelta, según el reporte preliminar del Tribunal Supremo Electoral (TSE), acudió el 54.37 por ciento del padrón electoral, es decir de un total de siete millones 556 mil 873 votantes inscritos, acudieron cuatro millones 108 mil 615 personas.
El abstencionismo fue del 45.63 por ciento, esto según algunos representantes de mesas electorales, en los departamentos se debió a que los dos partidos que pasaron a segunda vuelta no convencieron a los ciudadanos.
En la primera vuelta electoral, el seis de septiembre, se dio un histórico de 71.33 por ciento de participación.
