La Conamar será integrada por el Viceministerio de Marina del ministerio de la Defensa Nacional; viceministerio de Sanidad Agropecuaria; así como los viceministerios de Ambiente, Comunicaciones, Energía y Minas, y Relaciones Exteriores, además del viceministerio de Integración y Comercio Exterior, y el secretario Ejecutivo del Consejo Nacional de Áreas Protegidas.

Las funciones de la Comisión serán las de recomendar políticas marítimas nacionales, la coordinación de la cooperación y participación de las instituciones involucradas.

También colaborará en la revisión periódica de las políticas marítimas que sean aprobadas.

La secretaría de Conamar, estará a cargo del ministerio de Comunicaciones, y se reunirá la comisión cada tres meses. Y a paritr de mañana estará vigenta la entidad.